Если под отображением ссылок подразумевается окно идентификации, то тут ничего не настраивается, за исключением того, что у самого слоя можно установить в свойствах первое отображаемое поле.
Если это окно не устраивает, то вариант один - программировать.
Связанные записи , при отображении в этом окне, будут нумероваться по ObjectID, или по полю его заменяющему.
То показывает данные, то нет - это как? Была связь с объектом а потом исчезла? Если так, то или данные отредактировали, или глюк. А если какие-то из объектов связались, а какие-то нет, то проблема в ключах.